تا کنون مجموعه‌های انیمیشنی متعددی با عنوان «لاک‌پشت‌های نینجا» (Teenage Mutant Ninja Turtles) ساخته شده است. یکی از این مجموعه‌ها، مجموعه‌ای بود که در فاصلۀ بین سالهای 2003 تا 2009 میلادی تولید و پخش شد (تاریخ درج شده مربوط به نسخۀ اصلی مجموعه است). در این سری تغییرات زیادی نسبت به سری پیش دیده می‌شد. شخصیت‌پردازی‌ها بسیار قویتر شده و طراحی شخصیتها، محیطها و داستانها حالت کاملاً جدی‌تری به خود گرفته بود. تعداد کاراکترهای فرعی افزایش یافته بود و سعی شده بود که داستانها تنوع و استحکام بیشتری داشته باشند. داستانها برخی دنباله‌دار و برخی تک قسمتی بودند ولی در کل رابطه‌ای منطقی و نسبتاً منظم در خط سیر کلی داستانها دیده می‌شد. اگر بخواهیم به طور خلاصه این سری را توصیف کنیم باید گفت که این سری بیشتر مخاطبین بزرگسال (نوجوانان و جوانان) را هدف گرفته بود و تلاش داشت از حالت کودکانۀ سری قبل فاصله بگیرد.

یکی دیگر از نکات جالب این سری این بود که برخی از فصلها از لحاظ سبک و سیاقِ ساختاری و داستانی، تفاوت عمده‌ای با سایر فصلها داشتند. حتی برخی از آنها عنوان مستقل و جداگانه‌ای را نیز یدک می‌کشیدند. به این عنوانها در ادامه اشاره شده است:

• فصل 5 تحت عنوان: قسمتهای گمشده (The Lost Episodes)
• فصل 6 تحت عنوان: سریع به جلو (Fast Forward)
• فصل 7 تحت عنوان: بازگشت به فاضلاب (Back to the Sewer)

به اعتقاد بسیاری از کارشناسان و مخاطبان آثار انیمیشنی، مجموعۀ تولید شده در حدفاصل سالهای 2003 تا 2009 میلادی، موفقترین و ارزشمندترین مجموعۀ تلویزیونی تاریخ لاک‌پشت‌های نینجا است. البته در اکثر نظرسنجی‌های صورت گرفته، فصلهای ابتدایی این سری (فصلهای 1 تا 4) از محبوبیت و اعتبار بیشتری نسبت به فصلهای انتهایی برخوردار بوده‌اند.

تیتراژ «لاک‌پشت‌های نینجا: سریع به جلو»
(نکته: این تیتراژ مختص فصل‌ 6 می‌باشد)

تیتراژ «لاک‌پشت‌های نینجا: بازگشت به فاضلاب»
(نکته: این تیتراژ مختص فصل‌ 7 می‌باشد)